Bu miktarın yüzde 90.9'unu diğer enerji KİT'lerinden Elektrik Üretim A.Ş. (EÜAŞ) ve Hamitabat Elektrik Üretim Ticaret A.Ş'nin (HEAŞ) kuruma olan borçları oluşturuyor. Hazine Müsteşarlığı'nın 2006 KİT Pay Sahipliği Raporu'na göre, BOTAŞ'a en borçlu kuruluş devletin elektrik üretiminden sorumlu enerji KİT'i EÜAŞ'ın, BOTAŞ'a toplam borcu 8 milyar 748 milyon YTL'ye ulaştı. HEAŞ'ın BOTAŞ'a toplam 788 milyon YTL borcu bulunuyor. BOTAŞ'a İZGAZ'ın 60 milyon YTL, İGDAŞ'ın 2 milyon YTL, EGO'nun ise 677 milyon YTL borcu bulunuyor.